29. marec, 2024 | Univerza v Arkansasu za medicinske vede (UAMS) je nedavno gostila obsežno delavnico o zaporedju genomov od 18. do 20. marca, privabila široko paleto dodiplomskih, podiplomskih študentov in fakulteto iz ustanov po državi. Na delavnico se je osebno udeležilo več kot 30 udeležencev, dodatnih 30 pa se jih je pridružilo preko spleta. Dogodek se je izkazal kot neprecenljiva platforma za učenje o najnovejših razvojih na tem področju študija.
Prof. dr. David Ussery, izredni profesor na Medicinski fakulteti Oddelek za biomedicinsko informatiko, je predaval in udeležencem predstavil obsežno količino podatkov, ustvarjenih s pomočjo zaporedja genomov. Pojasnil je potrebo po inovativnih orodjih in tehnikah za učinkovito upravljanje in analizo te eksplozije informacij. Eden takšnih orodij, umetna inteligenca (AI), se je izkazal kot ključen element pri obdelavi obsežnih nizov podatkov. AI raziskovalcem zagotavlja platformo konsolidiranega znanja, kar jim omogoča, da nadgrajujejo obstoječe raziskave brez potrebe po velikih časovnih naložbah v predhodne naloge.
Z nenehnim naraščanjem količine genomskih podatkov so potrebni večji in močnejši super računalniki za shranjevanje, dostop in povečanje teh podatkov. Dr. Ussery je izpostavil nedavno sodelovanje med Dansko in Nvidia, vodilnim na področju računalništva AI, pri ustanovitvi nacionalnega centra za inovacije pri AI. Ta center bo gostil enega najmočnejših AI super računalnikov na svetu, namenjen pospeševanju raziskav in inovacij na različnih področjih, vključno s zdravstvom, življenjskimi znanostmi in zeleno preobrazbo.
Integracija AI računskih zmogljivosti ima potencial, da revolucionira raziskave in razvoj na področjih, kot so odkrivanje zdravil, diagnoza bolezni in zdravljenje. Z učinkovito obdelavo velikih nizov podatkov lahko AI olajša pozitivno preobrazbo največjih izzivov družbe. Ta prelomni pristop se ujema z misijo Fundacije Novo Nordisk, kot je poudarjeno v nedavno objavljenem članku, ki ga je delil dr. Ussery med delavnico.
Dr. Ussery je poudaril, da namen ustanavljanja največjega računalnika na svetu ni le v pomoč fiziki, astronomiji ali splošnim aplikacijam AI, ampak predvsem v reševanju ogromne količine bioloških zaporednih informacij. Ti podatki so ključni, zlasti na področju življenjskih znanosti, saj omogočajo raziskovalcem razumevanje izbruhov bolezni in spodbujajo napredke na področju zdravstva.
Kljub skrbem glede obsežne uporabe AI je dr. Ussery zagovarjal njen pozitiven vpliv. Delil je, kako uporablja AI za združevanje svojih raziskovalnih člankov, kar mu prihrani čas in izboljšuje njegove sposobnosti za nadaljnje raziskave. Poleg tega je dr. Ussery izpostavil pomen znanstvenih računskih zmogljivosti, ki jih zagotavljajo visoko zmogljivi računalniki in ki nudijo neprecenljivo podporo raziskovalcem na področju visokoprehodne primerjalne genomike.
Na delavnici so udeleženci imeli priložnost predstaviti svoje lastne raziskave o primerjavi bakterijskih genomov. Posebej so študenti uporabljali Chat-GPT, platformo na osnovi AI, za odpravo težav in optimizacijo uporabe programske opreme R-BioTools. Ta premišljena uporaba AI poudarja njeno vrednost pri reševanju izzivov, s katerimi se srečujejo raziskovalci.
Zaporedje genoma omogoča celovito razumevanje genetskih informacij organizma, pomaga pri preučevanju različnih bolezni ter prispeva k napredku v diagnozi in zdravljenju. Raziskovalna ekipa dr. Usseryja se osredotoča na primerjavo bakterijskih genomov za identifikacijo izbruhov bolezni.
Letni genomske delavnice, ki potekajo na UAMS med proljetnimi počitnicami, so postale ključen dogodek na tem področju, zdaj v svojem sedmem letu. Te delavnice so podprte s strani Arkanzasove mreže za odličnost pri biomedicinskih raziskavah (INBRE), program, ki ga financira Nacionalni inštitutih za zdravje in je lociran na UAMS. To sponzorstvo si prizadeva širiti in okrepiti znanje o biomedicinskih raziskavah. Dr. Elizabeth Pierce, predsednica Oddelka za informacijske vede na Univerzi v Arkansasu v Little Rocku, je koordinirala letošnjo delavnico, pri čemer je poudarila široke aplikacije obsequenze genomov onkraj človeškega zdravja. Poudarila je njeno potencial v oblikovanju zdravil, personalizirani medicini, analizi rakavih celic, okoljski znanosti, živalski znanosti, kmetijstvu in ravnanju z odpadki.
Širok razpon udeležencev na delavnici odraža interdisciplinarno naravo genomskega področja. Študenti in fakulteta iz ustanov, kot so UA Little Rock, Univerza v Arkansasu v Pine Bluffu in Hendrix College, so prispevali svoje znanje in strokovnost na različnih področjih, vključno z analizo podatkov, genomiko, molekularnimi genetskimi funkcijami, raziskavami mikrobioma, nevrološkimi boleznimi, genetiko, genskim inženiringom, bioinformatiko, dednimi boleznimi, tolerantnostjo na sušo, prehranjevalnimi motnjami in raziskavami raka.
Delavnica je služila kot informativna in sodelovalna platforma, ki je udeležencem omogočila raziskovanje izjemnih napredkov na področju zaporedja genomov ter njegov vpliv na različne znanstvene discipline. Integracija računalniške moči AI in uporaba inovativnih orodij, kot je Chat-GPT, poudarjata ključno vlogo tehnologije pri bioloških raziskavah, ki odpirajo pot pomembnim odkritjem in napredkom v prihodnosti.
—
Pogosta vprašanja (FAQ)
V: Kaj je zaporedje genoma?
O: Zaporedje genoma je postopek določanja popolne genetske zasnove organizma ali vrste celic, kar znanstvenikom omogoča razumevanje genskih sprememb in njihovih posledic za bolezni, diagnozo in zdravljenje.
V: Kako umetna inteligenca prispeva k zaporedju genoma?
O: Umetna inteligenca (AI) igra ključno vlogo pri upravljanju in analizi ogromnih količin podatkov, ustvarjenih s pomočjo zaporedja genoma. Raziskovalcem zagotavlja konsolidirano znanje ter pospešuje razvoj in raziskave na različnih področjih, vključno s področjem zdravstva in življenjskih znanosti.
V: Katere so uporabe zaporedja genoma onkraj človeškega zdravja?
O: Zaporedje genoma najde uporabo na področjih kot so oblikovanje zdravil, personalizirana medicina, analiza rakavih celic, okoljske znanosti, živalska znanost, kmetijstvo in ravnanje z odpadki.
V: Kako lahko AI izboljša raziskovalne sposobnosti?
O: AI lahko optimizira raziskovalne procese, združuje raziskovalne članke, odpravlja težave in optimizira uporabo specializiranih orodij za programsko opremo, s tem pa prihrani čas in izboljša sposobnosti raziskovalcev.
V: Kakšna je vloga znanstvenih računskih zmogljivosti?
O: Visokozmogljivi računalniki in znanstvene računske zmogljivosti nudijo ključno podporo raziskovalcem, zlasti na področju visokoprehodne primerjalne genomike, s čimer omogočajo obdelavo in analizo velikih nizov podatkov.
The source of the article is from the blog guambia.com.uy