Istraživačima je već dugo vremena bio zagonetka kako imunosni sustav prepoznaje i suzbija infekcije i bolesti. Posebno je složen proces proučavanja interakcije između adaptivnih imunoreceptora (AIR), poput receptora T stanica (TCR) i receptora B stanica (BCR), s antigenima. Postojeće metode se oslanjaju na genetičke informacije sekvenci, zanemarujući bitne strukturne detalje koji određuju veznu snagu, što otežava precizna predviđanja.
Međutim, pojavio se proboj nazvan DeepAIR koji revolucionizira analizu vezivanja AIR-antigena. Za razliku od prethodnih metoda, DeepAIR integrira sekvencijalne i strukturne karakteristike AIR-a, uključujući predviđene strukturne podatke generirane pomoću AlfaFold2, vrlo preciznog predviđača proteina. Kombinirajući sekvencijalne i strukturne informacije, DeepAIR ima za cilj poboljšati točnost predviđanja načina vezivanja AIR-a za antigene.
Jedno od izvanrednih obilježja DeepAIR-a je njegove performanse. Postiže visoku korelaciju Pearsona od 0,813 u predviđanju afiniteta vezivanja TCR-a i impresivne vrijednosti medijanske površine ispod krivulje receiver-operating characteristic (AUC) od 0,904 i 0,942 za predviđanje reaktivnosti vezivanja TCR-a i BCR-a, redom. Ove metrike pokazuju učinkovitost DeepAIR-a u preciznom predviđanju snage vezivanja i reaktivnosti.
Osim toga, DeepAIR je pokazao obećavajući potencijal u identifikaciji bolesti. Analizirajući repertoare TCR-a i BCR-a, DeepAIR točno identificira pacijente s određenim bolestima poput karcinoma nosnog ždrijela i upalne bolesti crijeva. Ova sposobnost otvara mogućnosti za personaliziranu imunoterapiju i dublje razumijevanje imunološkog odgovora kod različitih bolesti.
Sveukupno, DeepAIR predstavlja značajan korak naprijed u razumijevanju funkcioniranja imunosnog sustava. Integracijom sekvencijalnih i strukturnih informacija, DeepAIR nadmašuje postojeće metode u predviđanju veze AIR-antigen. Nadalje, njegov potencijal za identifikaciju bolesti unutar imunoloških repertoara sugerira da može unaprijediti personaliziranu terapiju i razvoj prilagođenih cjepiva. S DeepAIR-om, istraživači su korak bliže dubljem razumijevanju prilagodljivog imuniteta, što će na kraju dovesti do učinkovitijih tretmana i intervencija.
The source of the article is from the blog elperiodicodearanjuez.es