ב-29 במרץ 2024 | אוניברסיטת ארקנסו למדעי הרפואה (UAMS) אירחה לאחרונה סדנה מקיפה על סידור גנומות בין ה-18 ל-20 במרץ, שמשיכה לתוכה קהל מגוון של סטודנטים מתוך תכניות לתארים ראשונים, תכניות לתארים מתקדמים ומרצים ממוסדות בכל המדינה. ל-30 משתתפים התרכזו בסדנה באופן פיזי, בעוד עוד 30 הצטרפו באופן מקוון. האירוע הוכיח להיות פלטפורמה בלתי יציבה ללמידה אודות ההתפתחויות האחרונות בתחום זה.
הפרופסור דייוויד יוסרי, פרופסור מובחן במחלקה להידרדרול של רפואה בקולג' הרפואה, מסר הרצאה שמציגה למשתתפים את כמות הנתונים העצומה שנוצרת דרך סידור גנומות. הוא נתן פרטי דרישה לכלים וטכניקות חדשניים לניהול ולניתוח של ההתפרצות הזו של מידע. כלי כזה, AI אומץ, זיהה כמרכיב קריטי בעיבוד המאגרים העצומים. AI מספק לחוקרים פלטפורמה על מעמד הידע, מאפשרת להם לבנות על מחקרים קיימים מבלי להשקיע זמן במשימות ראשוניות
תוך שמירה על כמות המידע הגנומי שהולכת ומתרבית, נדרשים מחשבים עוצמתיים מר ויותר לאחסן, לגשת ולהגביר את המידע הזה. ד"ר יוסרי הדגיש את השיתוף האחרון בין דנמרק ל- Nvidia, מובילה בתחום חישובי AI, על הקמת מרכז לאומי לחדשנות AI. מרכז זה יארח אחת מן המחשבים העוצמתיים בעולם, המיועד להאיץ מחקר וחדשנות בתחומים שונים, כולל בתי חולים, מדעי החיים ומעבר ירוק.
השילוב של הכוח החישובי של AI מחזיק בפוטנציאל למהפך במחקר ופיתוח בתחומים כמו גילוי תרופות, דיאגנוזה של מחלות וטיפול. דרך עיבוד יעיל של מאגרי מידע גדולים, AI יכול לקלוט את ההמרה החיובית של האתגרים המשמעותיים ביותר של החברה. גישת פורץ דרך זו דבקה את משימת קרן נובו נורדיסק, כפי שהודגש במאמר שפורסם לאחרונה שנשתף ד"ר יוסרי במהלך הסדנא.
ד"ר יוסרי הדגיש כי הסיבה להקמת המחשב הגדול בעולם הייתה לא רק לסייע בפיזיקה, אסטרונומיה או ביישומים כלליים של AI, אלא להתמודד עם כמות המידע הביולוגית הקטלנית. מידע זה חיוני, במיוחד בתחום מדעי החיים, שמספק לחוקרים להבין את פרשת המחלות ולנהל התקדמויות בתחום הבריאות.
למרות דאגות בנוגע לשימוש הרחב ב- AI, ד"ר יוסרי עידד את ההשפעה החיובית שלה. הוא שיתף כיצד הוא משתמש ב- AI כדי לקonsolidateסול את מאמרי המחקר שלו, מפחית זמן ומשפר את מערכות היכולות שלו לבמשך מחקר נוסף. בנוסף, ד"ר יוסרי הדגיש את החשיבות של יכולות חישוב מדעיות שניתנות על ידי מחשבים עם ביצועים גבוהים, המציעים תמיכה בלתי נתפקת לחוקרים בתחום גנומיקה עם קישורים עבורים עבורים.
במהלך הסדנה, המשתתפים יישו את עצמם בהזדמנות להציג את מחקריהם בהשוואת גנומי חיידקים. תלמידים מסוימים נהלו שימוש במערכת מבוססת AI, Chat-GPT, לפתרון בעיות ולהפחתת מורכבות בשימוש בתוכנה R-BioTools. שימוש יעיל וחכמים בAI מחליק את הדרך שזה מגייס את ערכו בגישה לאתגרים שנתקלים בתחום המחקר
סידור גנומות מספק הבנה שלמה של מידע הגנטי של אורגניזם, המסייע לחקר של מספר מחלות שונות ומשפיע על התקדמויות בתחום ההנחייה והטיפול. צוות המחקר של ד"ר יוסרי מתמקד בהשוואת הגנומים של חיידקים לזיהוי התפרצויות מחלות.
הסדנאות השנתיות בתחום הגנומיקה שמתקיימות ב-UAMS במהלך החפים מתקופת חג הפסחא, הפכו לאירוע חיוני בתחום, עכשיו בשנת השביעית שלן. הסדנות מאומצות על ידי הרשת למחקרק ביומדית רמה (INBRE), מוסד שקיבל כלכלת מימון מקומי למכון הלאומי לבריאות ומקום. מטרת המימון הנ"ל היא להרחיב ולחזק ידע בתחום המחקרים ביומדיים. ד"ר אליזבת פירס, יו"ר מחלקת מדעי המידע באוניברסיטת ארקנסו בליטל רוק, תיארה את הסדנה של שנה זו, מדגישה את יישומיה הרחבים של סידור גנומות מעבר לבריאות האדם. היא הדגישה את פוטנציאלה בעיצוב תרופות, ברפואה אישית, בניתוח תאי סרטן, במדע הסביבה, במדע בעלי החיים, בחקלאות ובניהול פסולת.
המגוון הרחב של המשתתפים בסדנה משקף את האופי הבין תחומי של תחום הגנומיקה. סטודנטים ומרצים ממוסדות כגון חנוק ת' רוק, אוניברסיטת ארקנסו בפיין בלאף, וקולג' הנדריקס תרמו את המומחיות והידע שלהם בתחומים שונים, כגון ניתוח המידע, גנומיקה, תפקודים מולקולריים של גנים, מחקר מיקרוביום, מחלות עצביות, גנטיקה, הנדסה גנטית, מידע ביואינפורמטיקה, מחלות ירושתיות, עמידות ליבוש, הפסקת אכילה, ומחקר סרטן.
הסדנה שימשה כמשק עיניא ושיתופית, מאפשרת למשתתפים לחקור את ההתפתחויות המסחנות בסידור גנומות ואת השפעתו על תחומים מדעיים שונים. שילוב כוחות המחשב של AI ושימוש בכלים חדשניים כמו Chat-GPT מחזק את התפקיד הקריטי של הטכנולוגיה במחקרי הביורפואה, מפתח את הדרך לגילויים משמעותיים ולתקדמות עתידיות.
—
שאלות נפוצות (FAQ)
ש: מהו סידור גנומות?
ת: סידור גנומות הוא התהליך של קביעת התרכובת הגנטית המלאה של אורגניזם או סוג תא, אשר מאפשר למדענים להבין שינויים גנטיים והשלכותיהן על מחלות, דיאגנוזה וטיפול.
ש: איך תפקידה של קידום המחשב בלמידה?
ת: גיבורת המחשב בוססת על תפקוד מנהל וניתוח של כמויות עצומות של מידע שמיוצר דרך סידור גנומות. היא מספקת לחוקרים מידע מאוחד ומאיצה במחקר ופיתוח בתחומים שונים, כולל בתי חולים ומדע
The source of the article is from the blog hashtagsroom.com