29. marts 2024 | Nylige begivenheder på University of Arkansas for Medical Sciences (UAMS) omfattede en omfattende workshop om genomsekventering fra den 18.-20. marts. Workshoppen tiltrak en mangfoldig gruppe af studerende på bachelor- og kandidatniveau samt fakultet fra institutioner på tværs af staten Arkansas. Over 30 deltagere var til stede personligt, mens yderligere 30 deltog online. Begivenheden viste sig at være en uvurderlig platform til at lære om de seneste udviklinger på dette studieområde.
Dr. David Ussery, en fremtrædende professor ved College of Medicine Department of Biomedical Informatics, holdt et foredrag, der introducerede deltagerne for den enorme mængde data, der genereres gennem genomsekventering. Han forklarede behovet for innovative værktøjer og teknikker til at håndtere og analysere denne eksplosion af information effektivt. Et sådant værktøj, Kunstig Intelligens (AI), har vist sig at være en afgørende komponent for at bearbejde de massive datamængder. AI giver forskere en platform af konsolideret viden, hvilket gør det muligt for dem at bygge videre på eksisterende forskning uden behov for at investere signifikant tid i forarbejdet.
Med den stadigt øgede mængde genomisk data kræves større og mere kraftfulde supercomputere til at lagre, få adgang til og udvide denne data. Dr. Ussery fremhævede det nylige samarbejde mellem Danmark og Nvidia, en leder inden for AI-computing, om etableringen af et nationalt center for AI-innovation. Dette center vil huse en af verdens mest robuste AI-supercomputere med det formål at accelerere forskning og innovation på tværs af forskellige områder, herunder sundhedspleje, biovidenskab og grøn omstilling.
Integrationen af AI-computingkraften har potentiale til at revolutionere forskning og udvikling på områder som lægemiddelopdagelse, sygdomsdiagnose og -behandling. Gennem effektiv behandling af store datasæt kan AI lette den positive transformation af samfundets største udfordringer. Denne banebrydende tilgang stemmer overens med Novo Nordisk Fondens mission, som blev fremhævet i en nyligt offentliggjort artikel delt af Dr. Ussery under workshoppen.
Dr. Ussery pointerede, at årsagen til etablering af verdens største computer ikke udelukkende var at hjælpe inden for fysik, astronomi eller generelle AI-applikationer, men derimod at tackle den enorme mængde biologisk sekvensinformation. Disse data er afgørende, især inden for biovidenskab, og giver forskere mulighed for at forstå sygdomsudbrud og fremme fremskridt inden for sundhedspleje.
Trods bekymringer vedrørende den udbredte brug af AI, garanterede Dr. Ussery for dens positive indvirkning. Han delte, hvordan han anvender AI til at konsolidere sine forskningsartikler, hvilket sparer tid og styrker hans evner til yderligere forskning. Derudover fremhævede Dr. Ussery betydningen af videnskabelige computerfærdigheder leveret af højtydende computere, der tilbyder uvurderlig støtte til forskere på området for høj-effektiv komparativ genomik.
Under workshoppen fik deltagerne mulighed for at præsentere deres egen forskning om sammenligning af bakteriegenomer. Blandt andet anvendte flere studerende Chat-GPT, en AI-baseret platform, til at løse problemer og optimere deres brug af R-BioTools-software. Denne opfindsomme anvendelse af AI understreger dens værdi i at tackle udfordringer, som forskere står over for.
Genomsekventering giver en omfattende forståelse af et organisms genetiske information, hvilket letter studiet af forskellige sygdomme og bidrager til fremskridt inden for diagnose og behandling. Dr. Usserys forskerhold fokuserer på at sammenligne bakteriegenomer for at identificere sygdomsudbrud.
De årlige genomik-workshops afholdt på UAMS i løbet af forårsferien er blevet en væsentlig begivenhed inden for feltet og er nu i deres syvende år. Disse workshops sponsoreres af Arkansas IDeA Network of Biomedical Research Excellence (INBRE), et program finansieret af National Institutes of Health og baseret på UAMS. Dette sponsorat sigter mod at udvide og styrke viden om biomedicinsk forskning. Dr. Elizabeth Pierce, formand for instituttet for informationsvidenskab på University of Arkansas i Little Rock, koordinerede årets workshop, hvor fokus lå på genomsekventeringens brede anvendelsesområder ud over menneskers sundhed. Hun fremhævede dens potentiale inden for lægemiddeldesign, personlig medicin, analyse af kræftceller, miljøvidenskab, dyreværn, landbrug og affaldshåndtering.
Den store variation af deltagere ved workshoppen afspejler genomikkens tværfaglige karakter. Studerende og fakultet fra institutioner som UA Little Rock, University of Arkansas i Pine Bluff og Hendrix College bidrog med deres ekspertise og viden inden for forskellige områder, herunder dataanalyse, genomik, molekylære genfunktioner, forskning i mikrobiom, neurologiske sygdomme, genetik, genetisk ingeniørarbejde, bioinformatik, arvelige sygdomme, tørketolerance, spiseforstyrrelser og kræftforskning.
Workshoppen fungerede som en informativ og samarbejdsvillig platform, der gjorde det muligt for deltagerne at udforske de bemærkelsesværdige fremskridt inden for genomsekventering og dets indvirkning på forskellige videnskabelige discipliner. Integrationen af AI-computingkraft og brugen af innovative værktøjer som Chat-GPT understreger teknologiens afgørende rolle inden for biomedicinsk forskning, hvilket baner vejen for betydningsfulde opdagelser og fremskridt i fremtiden.
—
Ofte stillede spørgsmål (FAQ)
The source of the article is from the blog mivalle.net.ar