Nové trendy v sekvencování genomu a role umělé inteligence v biologickém výzkumu

29. března 2024 | Univerzita v Arkansasu pro lékařské vědy (UAMS) nedávno hostila komplexní workshop o sekvencování genomu od 18. do 20. března, přičemž přilákala rozmanitou skupinu bakalářských studentů, postgraduálních studentů a vyučujících z různých institucí napříč státem. Přes 30 účastníků se zúčastnilo workshopu osobně, zatímco dalších 30 se připojilo online. Akce se ukázala být neocenitelnou platformou pro poznávání nejnovějších vývojů v této oblasti studia.

Dr. David Ussery, významný profesor na lékařské fakultě v oddělení biomedicínské informatiky, přednesl přednášku, která zavedla účastníky do obrovského množství dat generovaných pomocí sekvencování genomu. Vysvětlil potřebu inovativních nástrojů a technik pro efektivní správu a analýzu této exploze informací. Jedním z takových nástrojů, Umělá inteligence (AI), se stala klíčovým prvkem zpracování obrovských datasetů. AI poskytuje výzkumníkům platformu s konsolidovanými znalostmi, která jim umožňuje navazovat na stávající výzkum bez nutnosti investovat značný čas do předběžných úkolů.

S nárůstem kvantity genomových dat jsou potřeba větší a výkonnější superpočítače k ukládání, přístupu a rozšíření těchto dat. Dr. Ussery zdůraznil nedávnou spolupráci mezi Dánskem a Nvidií, lídrem v oblasti AI výpočtů, na zřízení národního centra pro inovace v oblasti umělé inteligence. Toto centrum bude domovem jednoho z nejvýkonnějších superpočítačů s AI na světě, který je určen k urychlení výzkumu a inovací napříč různými oblastmi, včetně zdravotnictví, biomedicíny a zelené transformace.

Integrace výpočetní síly AI má potenciál zásadně změnit výzkum a vývoj v oblastech jako je objevování léčiv, diagnostika nemocí a léčba. Díky efektivnímu zpracování rozsáhlých datasetů může AI usnadnit pozitivní transformaci největších výzev společnosti. Tento inovativní přístup se shoduje s misí Nadace Novo Nordisk, jak zdůrazněno v nedávno publikovaném článku sdíleném Dr. Usserým během workshopu.

Dr. Ussery zdůraznil, že důvodem zřízení největšího počítače na světě nebylo pouze pomoci v oblasti fyziky, astronomie nebo obecných aplikací AI, ale spíše řešit obrovské množství biologických sekvencí informací. Tato data jsou důležitá, zejména v oboru biomedicín, což výzkumníkům umožňuje porozumět výskytům onemocnění a posouvat pokroky v oblasti zdravotní péče.

Navzdory obavám ohledně rozšířeného používání AI, Dr. Ussery zaručil její pozitivní dopad. Sdílel, jak využívá AI k konsolidaci svých výzkumných prací, což šetří čas a rozšiřuje jeho schopnosti pro další výzkum. Kromě toho Dr. Ussery zdůraznil význam vědeckých výpočetních schopností poskytovaných vysokorychlostními počítači, které nabízejí nepostradatelnou podporu výzkumníkům v oblastech vysokoprůtokové srovnávací genomiky.

Během workshopu měli účastníci příležitost představit své vlastní výzkumy porovnávání bakteriálních genomů. Několik studentů využilo Chat-GPT, platformu založenou na AI, k odstranění problémů a zjednodušení použití softwaru R-BioTools. Tento schopný přístup AI zdůrazňuje její hodnotu v řešení výzev, jimž čelí výzkumníci.

Sekvencování genomu poskytuje komplexní porozumění genetickým informacím organismu, které pomáhají při studiu různých onemocnění a přispívají k pokrokům v diagnostice a léčbě. Výzkumný tým Dr. Usseryho se zaměřuje na porovnávání bakteriálních genomů s cílem identifikovat výskyty nemocí.

Každoroční genetické workshopy pořádané na UAMS během jarních prázdnin se staly klíčovou událostí v oboru, nyní v jejich sedmém roce. Tyto workshopy jsou sponzorovány Arkansas IDeA Network of Biomedical Research Excellence (INBRE), programem financovaným Národními ústavy zdraví a sídlícím v UAMS. Tato sponzorství si klade za cíl rozšíření a posílení znalostí o biomedicínském výzkumu. Dr. Elizabeth Pierce, předsedkyně oddělení informačních věd na Univerzitě v Arkansasu v Little Rocku, koordinovala letošní workshop, zdůrazňuje široké uplatnění sekvencování genomu mimo lidské zdraví. Podtrhla jeho potenciál v návrhu léčiv, personalizované medicíně, analýze buněk rakoviny, environmentální vědě, vědě o zvířatech, zemědělství a nakládání s odpady.

Rozmanitý okruh účastníků workshopu odráží interdisciplinární povahu genetiky. Studenti a vyučující z institucí jako UA Little Rock, University of Arkansas v Pine Bluffu a Hendrix College přispěli svými znalostmi a odborností napříč různými oblastmi, včetně analýzy dat, genetiky, molekulárních funkcí genů, výzkumu mikrobiomu, neurologických onemocnění, genetiky, genového inženýrství, dědičných onemocnění, tolerance k suchu, poruch stravování a výzkumu rakoviny.

Workshop sloužil jako informativní a spolupracovní platforma, umožňující účastníkům objevovat pozoruhodné pokroky v sekvencování genomu a jeho dopad na různé vědecké disciplíny. Integrace výpočetní síly AI a využití inovativních nástrojů jako je Chat-GPT posiluje klíčovou roli technologií v biomedicínském výzkumu, otevírajíc cestu k významným objevům a pokrokům v budoucnosti.

Často kladené dotazy (FAQ)

The source of the article is from the blog maltemoney.com.br

Web Story

Privacy policy
Contact