Le 29 mars 2024 | L’Université des Sciences Médicales de l’Arkansas (UAMS) a récemment organisé un atelier complet sur le séquençage du génome du 18 au 20 mars, attirant un groupe diversifié d’étudiants de premier cycle, d’étudiants diplômés et de professeurs d’institutions à travers l’État. Plus de 30 participants ont assisté à l’atelier en personne, tandis que 30 autres ont rejoint en ligne. Cet événement s’est avéré être une plateforme inestimable pour se familiariser avec les dernières avancées dans ce domaine d’étude.
Le Dr. David Ussery, professeur émérite au Département d’Informatique Biomédicale de la Faculté de Médecine, a donné une conférence qui a présenté aux participants la vaste quantité de données générées par le séquençage du génome. Il a expliqué le besoin d’outils et de techniques innovants pour gérer et analyser efficacement cette explosion d’informations. Un tel outil, l’Intelligence Artificielle (IA), s’est imposé comme un élément crucial dans le traitement des ensembles de données massives. L’IA offre aux chercheurs une plateforme de connaissances consolidées, leur permettant de construire sur des recherches existantes sans avoir besoin d’investir un temps significatif dans des tâches préliminaires.
Alors que la quantité de données génomiques continue d’augmenter, des supercalculateurs de plus en plus grands et puissants sont nécessaires pour stocker, accéder et augmenter ces données. Le Dr. Ussery a mis en avant la récente collaboration entre le Danemark et Nvidia, un leader de l’informatique en IA, dans l’établissement d’un centre national d’innovation en IA. Ce centre abritera l’un des supercalculateurs en IA les plus robustes au monde, destiné à accélérer la recherche et l’innovation dans différents domaines, y compris la santé, les sciences de la vie et la transition écologique.
L’intégration de la puissance de calcul de l’IA a le potentiel de révolutionner la recherche et le développement dans des domaines tels que la découverte de médicaments, le diagnostic des maladies et les traitements. Grâce au traitement efficace de grands ensembles de données, l’IA peut faciliter la transformation positive des défis les plus importants de la société. Cette approche révolutionnaire s’aligne avec la mission de la Fondation Novo Nordisk, comme le souligne un article récemment publié partagé par le Dr. Ussery lors de l’atelier.
Le Dr. Ussery a souligné que la raison d’établir l’ordinateur le plus grand au monde n’était pas uniquement d’aider en physique, en astronomie ou en applications générales de l’IA, mais plutôt de s’attaquer à l’immense quantité d’informations sur les séquences biologiques. Ces données sont vitales, notamment dans le domaine des sciences de la vie, permettant aux chercheurs de comprendre les épidémies de maladies et de faire avancer les progrès en matière de santé.
Malgré les préoccupations concernant l’utilisation généralisée de l’IA, le Dr. Ussery a garanti son impact positif. Il a partagé comment il utilise l’IA pour consolider ses articles de recherche, gagnant du temps et améliorant ses capacités pour des recherches futures. De plus, le Dr. Ussery a souligné l’importance des capacités de calcul scientifique fournies par les ordinateurs haute performance, offrant un soutien inestimable aux chercheurs dans le domaine de la génomique comparative à haut débit.
Pendant l’atelier, les participants ont eu l’opportunité de présenter leurs propres recherches sur la comparaison des génomes bactériens. Plusieurs étudiants ont utilisé Chat-GPT, une plateforme basée sur l’IA, pour résoudre les problèmes et rationaliser leur utilisation du logiciel R-BioTools. Cette application ingénieuse de l’IA souligne sa valeur dans la résolution des défis rencontrés par les chercheurs.
Le séquençage du génome fournit une compréhension complète de l’information génétique d’un organisme, aidant à l’étude de diverses maladies et contribuant aux progrès dans le diagnostic et le traitement. L’équipe de recherche du Dr. Ussery se concentre sur la comparaison des génomes bactériens pour identifier les épidémies de maladies.
Les ateliers annuels de génomique organisés à l’UAMS pendant les vacances de printemps sont devenus un événement essentiel dans le domaine, maintenant dans leur septième année. Ces ateliers sont parrainés par le Réseau Arkansas IDeA pour l’Excellence en Recherche Biomédicale (INBRE), un programme financé par les Instituts Nationaux de la Santé et basé à l’UAMS. Ce parrainage vise à élargir et renforcer les connaissances sur la recherche biomédicale. Le Dr. Elizabeth Pierce, Présidente du Département des Sciences de l’Information à l’Université de l’Arkansas à Little Rock, a coordonné l’atelier de cette année, mettant en avant les applications étendues du séquençage du génome au-delà de la santé humaine. Elle a souligné son potentiel dans la conception de médicaments, la médecine personnalisée, l’analyse des cellules cancéreuses, les sciences environnementales, les sciences animales, l’agriculture et la gestion des déchets.
La diversité des participants assista…
The source of the article is from the blog foodnext.nl