29. marec 2024 | Nedávno sa na Lekárskej fakulte Univerzity v Arkansas (UAMS) konal detailný seminár o genomickej sekvenácii od 18. do 20. marca, ktorý prilákal rôznorodú skupinu prezenčných aj online účastníkov základných škôl, vysokých škôl a fakúlt zo štátu. Viac ako 30 ľudí sa zúčastnilo seminára osobne a ďalších 30 sa pripojilo online. Tento podujatí sa ukázalo ako nenahraditeľná platforma na spoznávanie najnovších vývojov v tejto oblasti štúdia.
Dr. David Ussery, významný profesor z Kliniky Informačných Vied Lekárskej fakulty, predniesol prednášku, ktorá zoznámila účastníkov s obrovským množstvom dát, ktoré vznikajú v dôsledku genomickej sekvenácie. Vysvetlil potrebu inovačných nástrojov a techník na efektívne spracovanie a analýzu tohto množstva informácií. Jedným z takýchto nástrojov, ktorý sa stal kľúčovým pri spracovaní masívnych sád údajov, je Umelá Inteligencia (AI). AI poskytuje výskumníkom platformu s konsolidovanými znalosťami, čím im umožňuje stavať na existujúcom výskume bez potreby investovať veľa času do predbežných úloh.
S narastajúcim množstvom genomických dát je potrebné mať k dispozícii čoraz väčšie a výkonnejšie superpočítače na uchovávanie, prístup a rozšírenie týchto dát. Dr. Ussery zdôraznil nedávnu spoluprácu medzi Dánskom a spoločnosťou Nvidia, lídrom v oblasti výpočtove sa AI, pri zriadení národného centra pre inovácie v oblasti AI. Toto centrum bude domovom jedného z najvýkonnejších AI superpočítačov na svete s cieľom urýchliť výskum a inovácie vo viacerých oblastiach, vrátane zdravotníctva, biomedicíny a zelenej tranzície.
Integrácia výpočtovej sily AI má potenciál revolucionizovať výskum a vývoj v oblastiach, ako je objavovanie liekov, diagnostika chorôb a liečba. Prostredníctvom efektívneho spracovania veľkých sád údajov dokáže AI napomôcť k pozitívnym zmenám v najväčších výzvach, ktorým čelí spoločnosť. Tento inovačný prístup sa zhoduje s misiou Nadácie Novo Nordisk, ako bolo zdôraznené v nedávno zverejnenom článku, ktorý Dr. Ussery zdieľal počas seminára.
Dr. Ussery zdôraznil, že dôvod vytvorenia najväčšieho počítača na svete nebol len pomoc v oblasti fyziky, astronómie, alebo všeobecných aplikácií AI, ale skôr v boji s obrovským množstvom biologických sekvencií. Tieto dáta sú dôležité, najmä v oblasti biomedicíny, čo vedcom umožňuje porozumieť výskytom chorôb a posúvať sa vpred v oblasti zdravotnej starostlivosti.
Napriek obavám z rozsiahleho využitia AI, Dr. Ussery zaručil jeho pozitívny vplyv. Zdieľal, ako využíva AI na konsolidáciu svojich vedeckých prác, čím šetrí čas a rozširuje svoje schopnosti pre ďalší výskum. Okrem toho, Dr. Ussery zdôraznil dôležitosť vedeckých výpočtových schopností poskytovaných vysoko-výkonnými počítačmi, ktoré ponúkajú neoceniteľnú podporu pre výskumníkov v oblasti vysokovýkonných porovnávacích genómov.
Počas seminára mali účastníci príležitosť predstaviť svoj vlastný výskum o porovnaní bakteriálnych genómov. Nepochybne, niekoľko študentov využívalo platformu Chat-GPT, ktorá je založená na AI, na riešenie problémov a zjednodušenie využívania softvéru R-BioTools. Tento vynaliezavý spôsob využitia AI zdôrazňuje jeho hodnotu pri riešení problémov, ktorým čelia výskumníci.
Genomická sekvenácia poskytuje komplexné pochopenie genetických informácií organizmu, čím prispieva k štúdiu rôznych chorôb a vytváraniu pokroku v diagnostike a liečbe. Výskumný tím Dr. Usseryho sa zameriava na porovnávanie bakteriálnych genómov s cieľom identifikovať výskyty chorôb.
Ročné genómické semináre konané na UAMS počas prázdnin sa stali kritickou udalosťou v odvetví, teraz už v siedmom roku. Tieto semináre sú sponzorované sieťou Arkansas IDeA Network of Biomedical Research Excellence (INBRE), programom financovaným Národnými ústavmi zdravia a sídliacom na UAMS. Táto sponzorská činnosť si kladie za cieľ rozšíriť a posilniť vedu o biomedicínskom výskume. Dr. Elizabeth Pierce, vedúca Katedry Informačných Vied na Univerzite v Arkansas v Little Rock, koordinovala tento roční seminár, pričom zdôraznila široké možnosti aplikácií genomickej sekvenácie mimo ľudskej zdravotnej starostlivosti. Poukázala na jej potenciál pri návrhu liekov, personalizovanej medicíne, analýze bunkového raku, vede o životnom prostredí, vede o zvieratách, poľnohospodárstve a správe odpadov.
Rozmanitá skupina účastníkov seminára zrkadlí multidisciplinárny charakter genómiky. Študenti a pedagógovia z inštitúcií ako UA v Little Rock, Univerzita v Arkansas v Pine Bluff a Hendrix College prispeli so svojimi znalosťami a expertízou v rôznych oblastiach, vrátane analýzy údajov, genómiky, molekulárnych funkcií génov, výskumu mikrobiómov, neurologických ochorení, genetiky, genetického inžinierstva, dnes dedičných chorôb, tolerancie na suchá, porúch výživy a výskumu rakoviny.
Seminár slúžil ako informatívna a kolaboratívna platforma, kde účastníci mohli preskúmať pozoruhodné pokroky v genomickej sekvenácii a jej vplyvoch na rôzne vedné disciplíny. Integrácia výpočtovej sily AI a využívanie inovatívnych nástrojov ako Chat-GPT potvrdzujú kľúčovú úlohu technológií vo vykonávaní vedeckého výskumu, otvárajúc cestu pre významné objavy a pokroky v budúcnosti.
Často kladené otázky (FAQ)
The source of the article is from the blog newyorkpostgazette.com